Από την κλήρωση που πραγματοποιήθηκε τη Δευτέρα 9 Νοεμβρίου για την  Α’ Φάση – 2ης Σειρά  Κυπέλλου Ερασιτεχνών 2015 -2016 προέκυψαν τα κάτωθι ζευγάρια:

Α.Ο. ΕΘΝΙΚΟΣ ΚΕΦΑΛΟΝΙΑΣ – Α.Ε.Κ.

Α.Ο. ΔΙΛΙΝΑΤΑ – Α.Ο. ΕΙΚΟΣΙΜΙΑΣ

Α.Ο. ΣΑΜΗΣ – Α.Ο. ΦΩΚΑΤΑ

Α.Ο. ΠΑΛΛΗΞΟΥΡΙΑΚΟΣ – Π.Α.Ο. ΠΑΓΚΕΦΑΛΛΗΝΙΑΚΟΣ